생물공정연구센터는 1990년 설립되었으며 중점사업 추진 결과중 세계적으로 주목받고 있는 것으로는 미국 특허를 획득한 Air-Lift 반응기 개발, 최근 산업화 과정에 있는 생물학적 acrylamide의 생산, 연료용 알콜 대량 생산, 생분해성 고분자 개발 등 다수가 있으며, 특히 생분해성 고분자 polyhydroxyalkanoate에 관한 연구는 ACS, ISBP 등의 저명 국제 학술회의와 MIT, RIKEN 등의 해외 유수 기관에서 관련 연구자를 연사로 초청하고 협력을 요청하는 등 우수한 결과를 보이고 있다. 생물공학 관련 제품의 pilot 연구 등을 통한 대량 생산 관련 연구는 당 센터 고유의 사업이라 할 수 있으며 센터 보유 pilot plant 시설은 여러 산업체와 연구소에서도 유용하게 사용하고 있다.
센터 참여 교수들은 여러 분야에서 지속적으로 뛰어난 연구를 수행하고 있다.